Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms