Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms