Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Msx2Q03358 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms