Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Thbs2Q03350 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Thbs2Q03350 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms