Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms