Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms