Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Top2aQ01320 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms