Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gja5Q01231 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms