Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb2Q00977 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms