Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms