Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms