Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoa1Q00623 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms