Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mesp1P97309 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms