Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnikP83510 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnikP83510 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnikP83510 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnikP83510 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnikP83510 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnikP83510 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnikP83510 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnikP83510 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TnikP83510 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TnikP83510 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms