Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms