Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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UbdP63072 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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UbdP63072 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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UbdP63072 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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UbdP63072 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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UbdP63072 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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UbdP63072 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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UbdP63072 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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UbdP63072 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
UbdP63072 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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UbdP63072 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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UbdP63072 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UbdP63072 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
UbdP63072 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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