Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl23P62830 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Rpl23P62830 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Rpl23P62830 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl23P62830 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl23P62830 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl23P62830 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl23P62830 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl23P62830 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl23P62830 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms