Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gsc2P56916 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms