Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
GferP56213 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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