Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NcanP55066 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NcanP55066 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NcanP55066 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NcanP55066 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NcanP55066 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NcanP55066 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NcanP55066 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NcanP55066 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NcanP55066 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NcanP55066 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NcanP55066 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NcanP55066 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NcanP55066 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NcanP55066 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms