Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb4P54761 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms