Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CastP51125 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CastP51125 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CastP51125 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms