Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LmnaP48678 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LmnaP48678 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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