Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NodalP43021 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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NodalP43021 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NodalP43021 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NodalP43021 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NodalP43021 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NodalP43021 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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