Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TtlP38585 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TtlP38585 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TtlP38585 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms