Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
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