Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VtnP29788 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VtnP29788 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms