Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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