Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb1P28230 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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