Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms