Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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BdnfP21237 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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BdnfP21237 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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BdnfP21237 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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BdnfP21237 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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BdnfP21237 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BdnfP21237 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms