Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18528 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18528 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18528 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18528 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18528 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18528 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18528 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18528 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18528 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18528 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18528 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18528 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18528 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18528 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18528 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18528 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18528 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P18528 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P18528 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P18528 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P18528 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P18528 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
P18528 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P18528 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms