Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18525 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18525 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms