Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tgfb1P04202 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms