Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxa7P02830 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms