Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Ab1P01921 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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H2-Ab1P01921 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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H2-Ab1P01921 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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H2-Ab1P01921 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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H2-Ab1P01921 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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H2-Ab1P01921 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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H2-Ab1P01921 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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H2-Ab1P01921 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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H2-Ab1P01921 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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H2-Ab1P01921 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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