Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01797 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01797 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01797 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01797 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01797 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P01797 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms