Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BlmO88700 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BlmO88700 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BlmO88700 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BlmO88700 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BlmO88700 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BlmO88700 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BlmO88700 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BlmO88700 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BlmO88700 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BlmO88700 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BlmO88700 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BlmO88700 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BlmO88700 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BlmO88700 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BlmO88700 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BlmO88700 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BlmO88700 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BlmO88700 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BlmO88700 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BlmO88700 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BlmO88700 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BlmO88700 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BlmO88700 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BlmO88700 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BlmO88700 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BlmO88700 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms