Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BckdkO55028 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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BckdkO55028 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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BckdkO55028 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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BckdkO55028 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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BckdkO55028 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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BckdkO55028 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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BckdkO55028 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
BckdkO55028 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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BckdkO55028 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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BckdkO55028 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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