Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms