Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Opn1mwO35599 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Opn1mwO35599 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Opn1mwO35599 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms