Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms