Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Casq1O09165 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms