Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hps1O08983 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hps1O08983 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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