Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms