Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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