Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5458L7N219 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms