Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 2610037D02Rik-202ENSMUST00000185067 2997 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ndrg1-201ENSMUST00000005256 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm45714-201ENSMUST00000211466 2722 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm12664-201ENSMUST00000118306 913 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Olfr268-ps1-201ENSMUST00000121395 945 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Zfp738-204ENSMUST00000175678 609 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms