Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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BC024978J3QPC3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC024978J3QPC3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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BC024978J3QPC3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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