Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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